La scheda Arduino Due è basata sul microcontrollore Atmel SAM3X8E ARM Cortex-M3. È la prima scheda Arduino basata su un microcontrollore a core ARM a 32 bit. Dispone di 54 pin digitali di input/output (di cui 12 possono essere utilizzati come uscite PWM), 12 ingressi analogici, 4 UART (porte seriali hardware), un clock a 84 MHz, una connessione USB OTG, 2 DAC (da digitale ad analogico), 2 TWI, un jack di alimentazione, un header SPI, un header JTAG, un pulsante di reset e un pulsante di cancellazione. Attenzione: a differenza della maggior parte delle schede Arduino, la scheda Arduino Due funziona a 3,3V. La tensione massima che i pin I/O possono tollerare è di 3,3V. Applicare tensioni superiori a 3,3V a qualsiasi pin I/O potrebbe danneggiare la scheda. La scheda contiene tutto il necessario per supportare il microcontrollore; basta collegarla a un computer con un cavo micro-USB o alimentarla con un adattatore AC-DC o una batteria per iniziare. La Due è compatibile con tutti gli shield Arduino che funzionano a 3,3V e sono conformi al layout dei pin Arduino 1.0. La Due segue il layout dei pin 1.0: TWI: pin SDA e SCL situati vicino al pin AREF; IOREF: consente a uno shield collegato, con la configurazione adeguata, di adattarsi alla tensione fornita dalla scheda. Ciò consente la compatibilità degli shield con una scheda a 3,3V come la Due e con schede basate su AVR che operano a 5V; e un pin non connesso riservato per usi futuri.